集中講義「情報生命特別講義第二」の日程および内容について
2014年1月9日
平成25年度 集中講義「情報生命特別講義第二」の日程および内容について
日時： 2014年2月 5日（水）13：20－18：20
2014年2月12日（水）13：20－18：20
2014年2月12日（水）13：20－18：20
場所： すずかけ台 J2-1601 TV講義室
講師： 茂櫛 薫氏 （順天堂大学 ゲノム・再生医療センター, 東京医科歯科大学、生命情報学分野）
マイクロアレイデータの解析を中心に、RおよびBioconductorを用いた生命情報データの解法に関する講義と演習を行います。日頃より臨床データ・実験 データの解析に携わっており、生命情報データ解析に豊富な経験と知識を持つ茂櫛先生を講師としてお招きし、生命情報の初学者向けに実践的な解析法についての講義を行います。
○受講希望者は学籍番号、研究室、氏名を書き、1月28日（火）までにメール（office[at]acls.titech.ac.jp 件名：情報生命特別講義第二）してください。
※課程参加・準参加学生はなるべく早めに連絡ください。
○受講する学生はノートPCを持参の上、参加してください。
○初学者を対象とするが、事前に下記のサイトにおいてRおよびBioconductorについて学んでおくことを推奨します。
http://www.r-project.org/ ※
http://www.bioconductor.org/ ※
http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html ※
○シラバス
2月5日 (水)
2月5日 (水)
13:20 - 14:50 総論Ｒダウンロード、Bioconductorダウンロード
15:05 - 16:35 基本的なRの使い方と統計手法について
16:50 - 18:20 マイクロアレイデータの生データの取り扱いと正規化
15:05 - 16:35 基本的なRの使い方と統計手法について
16:50 - 18:20 マイクロアレイデータの生データの取り扱いと正規化
2月12日 (水)
13:20 - 14:50 統計処理によるバイオマーカー候補遺伝子の抽出
15:05 - 16:35 階層的クラスタリング、Gene Ontologyを用いた解析
16:50 - 18:20 k-NNやサポートベクターマシンによる判別、事例紹介、総合討論
※オフィスへの連絡の他に通常の学習申告が必要です。まだ申告をしてない学生は追加登録をしてください。 掲示ポスター
Details for the following program is announced:
"Advanced Computational Life Sciences II"
This courses is in Japanese.
